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配体相似性比较
obabel将sdf转成smi： obabel -isdf DC01_400000.sdf -O DC01.smi --append 'IDNUMBER' obabel进行序列相似性对比： obabel active-LJ.smi DC01.smi -ofpt > result-DC01

分享 2024-12-09 20:40:51 xiachaoyue
75.1登录方法
迁移登录登录85.2( dddc dddc1201) 登陆以后输入：ssh 172.21.75.1 密码：dddc1201

分享 2024-10-28 09:27:25 xiachaoyue
将sdf转成smi
obabel -i sdf analysis-psichic.sdf -o smi -O analysis-psichic.smi

分享 2024-09-12 18:24:16 xiachaoyue
equiscore结果处理(chemdiv)
1.遍历当前目录下所有扩展名为.sdf的文件，并将每个文件的文件名和文件内容的第一行IDNUMBER保存到一个名为result-2.csv的文件中。 for file in .sdf; do > echo "$file,$(head -n 1 "$file" | cut -c 1-9)" >> result-2.csv > done ###/home/jawang/xcy/p53/che

分享 2024-09-08 18:22:12 xiachaoyue
分享 2024-08-19 18:58:32 xiachaoyue
杂录

分享 2024-08-13 16:57:48 xiachaoyue
批量转sdf文件为smiles字符串

分享 2024-07-11 16:42:29 xiachaoyue
盲对接盒子的设置
用法：https://pymolwiki.org/index.php/DrawGridBox

虚拟筛选 2024-07-06 19:42:47 xiachaoyue