10.18 gmx_2022.5_vs install

配置GROMACS-2022.5
服务器：22223
172.21.85.23
/home/databank/zzy/software/vsremd-2022.5
下载安装包以及vsREMD的参数文件replicaexchange.cpp（这里是从22224上cp过来的）
  • tar -zxvf gromacs-2022.5.tar.gz
需要指定高版本gcc和g++的路径，写进环境变量也不太行
加参数重新编译
 22224上位置：gromacs-2022.5/src/gromacs/mdrun/replicaexchange.cpp
  • ### 几个注意点：gcc 的路径要变成自己的，要编译成gmx2022.5能用的
    • 

  • ### 还有 要注意在/home/databank/zzy/software/vsremd-2022.5/gromacs-2022.5/bulid 下执行cmake
    • 


    • 

  • cmake .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/home/databank/zzy/software/vsremd-2022.5/gromacs-2022.5/install_zzy -DGMX_MPI=ON -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DGMX_SIMD=AVX2_256 -DREGRESSIONTEST_DOWNLOAD=ON -D CMAKE_C_COMPILER=/home/databank/software/gcc/gcc1220/bin/gcc  -D CMAKE_CXX_COMPILER=/home/databank/software/gcc/gcc1220/bin/g++ 
    • 


  • make -j 100
  • make install
  • ### 环境变量 按照2022.5 的格式写
    • 


    • 

  • ## 测试
    • 

  • gmx_mpi mdrun -h