周丽萍 @957zlp

下载及安装 需要配合mgltools一起使用，所以需要先安装mgltools Download AutoDock4 – AutoDock (scripps.edu) 二进制版本，解压即可使用 对接流程（以带Ga金属配位的68Ga-FAPi04为例） 准备配体文件 因为gasteiger charges不能处理其中的Ga原子，所以用chem3D算出partial charge，将小分子存成mol

下载安装 其中的邀请码以及激活码需要发邮件问信息中心陆彩女老师 详细教程见软件 help 对于电荷的处理 所以不管我们在准备配体的时候给不给电荷，它都用不上（smina也是一样的）

以下mdp文件是在网上查到的，仅供参考，主要看控温控压方法 http://www.strodel.info/index_files/lecture/remd_0.mdp ; Run control integrator = md dt = 0.002 ; ps ! nsteps = 5000000;