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(小分子)卤键-EP模型在gromacs中的实现
参考链接:https://github.com/shiyu-wangbyte/MM-PB-GB-SA_Benchmarks/tree/main 一、小分子处理 1. gauss计算ESP(略)并拟合小分子RESP电荷 计算ESP这一步说明:个人认为若要使用小分子优化结构作为MD的初始小分子结构则在高斯计算的时候就优化,否则就高斯计算的时候就不要优化了(RESP电荷依赖于结构;且后续EP
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2026-05-27 09:51:26
lijintian
PPT修改图片输出分辨率
更改PPT输出图片默认分辨率 1. PowerPoint2019版本 2. win + R 输入regedit,确定 3. 找到目录:计算机\HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Office\16.0\PowerPoint\Options 4. 在右侧空白的地方右击鼠标,新建“DWORD(32位)值(D)”,此时会自动创建一个文件 5. 将新建文件的名称改为E
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2026-03-01 14:18:47
lijintian
D3pockets静态性质生成
服务器205 生成口袋 python27ana /home/zqchen/D3Pockets_WEB_UCB/PyPocket_Detect.py -r test.pdb 生成口袋的atm和pit文件在同一个文件夹 生成静态性质 atm,pit以及原始的pdb需要在同一个文件夹下 python27ana /home/zqchen/D3Pockets_Descriptors/d3pocket
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2024-07-19 20:01:18
lijintian
D3Pockets
Pockets generation [zqchen@DDB S_protein]$ python27ana $D3Pockets_UCB_HOME/PyPocket_Detect.py -r fixed.pdb [zqchen@DDB S_protein]$ python27ana $D3Pockets_UCB_HOME/gensinglePDBpml.py fixed.pdb [zqc
CADD相关技术分享
2024-07-19 14:39:03
lijintian
蛋白-小分子QMMM教程
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2022-12-28 21:21:28
lijintian
计算生物学
上课的资料就是PPT,无纸质课本 往年的ppt和考试资料都在压缩包里:
上海教育基地课程
2022-08-15 14:44:10
lijintian
分子生物学
课程资料 上课的资料就是PPT,无纸质课本 (上课听不听无所谓了,看看往年整理的资料就行,有时候会有签到) 考试资料 21年考题回忆:(五选三) 1.陈玲玲:cir RNA 2.王佳伟老师:植物应对荫蔽的适应机制 3.朱冰:表观遗传信息异常引起的疾病(prader -willi & angelmen syndrome )的原因是什么 4.孟飞龙:染色质组装的过程(D
上海教育基地课程
2022-08-15 14:31:50
lijintian
硕士英语
课程 英语综合 英语综合用到的课本如下: 英语综合上课会讲课本里的阅读,期中会有一次关于某个单元的单词完型测试作为平时分的一部分(每个老师不一样,我们是刘静老师上课) 期末考试的vocabulary部分是课本里的单词,我们这一届是1,2,3,4,5,7单元的单词,考前可以背一背 英语听说 每个老师不一样,戴融融老师上课会安排一个topic,然后小组讨论,再反馈给老师。 考试
上海教育基地课程
2022-08-15 08:53:43
lijintian
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