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计算SASA
PyMOL>alpha1_area=cmd.get_area("rbd") PyMOL>alpha2_area=cmd.get_area("ace2") PyMOL>beta1_area=cmd.get_area("ace2") PyMOL>ab1_area=cmd.get_area("6m0j") PyMOL>print alpha1_area 22077.7636719 PyMOL
pymol常用脚本
2022-03-05 13:52:08
lywu
接触面积sasa的计算
RBD-ACE2的接触面积(CSA)= (RBD的溶剂可及化面积 + ACE2的溶剂可及化面积– 复合物的溶剂可及化面积)/2 CSA计算过程中出现的问题比较多,分别测试了不同软件和程序对SASA计算的准确程度,大致结论如下: 1)GROMACS的sasa模块:非常不准确,两个完全分开的蛋白质计算所得的CSA仍有20 nm2 2)PyMOL的cmd.get_area模块:不准确,两个完全分开的蛋白
动力学常用命令
2022-03-03 14:26:56
lywu
时间表-模板
To do list
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2022-02-24 13:13:20
lywu
学术墙报模板
石禹龙师兄
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2022-02-22 09:47:25
lywu
机房打印机
课题组账号 647205 安装手册 https://jianguoyun.simm.ac.cn/p/DRvhnZMQKhi3Dw
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2022-02-21 09:25:34
lywu
cutoff的问题
文献阅读
2022-02-12 22:12:04
lywu
年终总结案例
2020总结&规划_pc 工作总结与汇报-王晓宇20190214 2021-01-27 年度总结-石禹龙
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2022-02-07 16:21:00
lywu
Endnote使用技巧
更改杂志名称的格式 可以按照杂志的要求下载对应的 term list 库,然后在outstyle中选择对应的term list即可
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2022-02-04 15:06:12
lywu
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