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D3Pockets可帮助药物设计及药物化学领域的研究人员研究比较靶标蛋白上多个潜在结合口袋的稳定性、连续性和相关性，进而选择最优的口袋以开展活性化合物发现与结构优化工作。

D3Targets-2019-nCoV是基于互联网的抗新冠肺炎（COVID-19）的药物靶标预测及虚拟筛选平台，该平台既可以为活性化合物预测潜在的作用靶标，也可开展基于多靶标多位点的药物虚拟筛选，以期推动抗COVID-19药物的快速研发。该平台主要有两个功能：一是针对在体内外实验研究中发现的活性化合物，预测其可能的靶标蛋白，帮助理解药物的作用机制，以促进结构优化和新药研发；二是可以选择与病毒侵入、复制和释放相关的病毒蛋白和人源蛋白靶标，开展多靶标、多构象、多结合位点的药物虚拟筛选，预测潜在的抗COVID-19活性化合物，以获得作用机制更加丰富的先导化合物。

D3DistalMutation是关于远端突变对酶活性影响的数据库。D3DistalMutation数据库包含有725种受远端单点突变影响的酶，并提供突变残基、活性变化描述相关的文本信息和显示出潜在口袋的蛋白三维结构文件的下载链接。