相互作用力分析
现有分析工具:
Protein Contacts Atlas网站
Molecular Operating Environment (MOE)软件
Proteins Plus: https://proteins.plus/
薛定谔:2D-sketch模块
部分非键极性相互作用力:
H-bond Metal-coordination Pi-Pi-stacking Pi-cation Salt-bridge
非极性相互作用力:
疏水作用
PLIP使用注意事项:
查询相互作用力时可以将小分子周围的氨基酸与小分子单独导出形成pdf文件,将pdf文件作为PLIP的输入文件