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TEAKKI教程: MD-复合物体系准备 科研技能分享的: 第3期-分子动力学操作 中文教程 GROMACS教程:漏斗网蜘蛛毒素肽的溶剂化研究:Amber99SB-ILDN力场|Jerkwin CMD/REMD/VSREMD差别: MD (分子动力学模拟): MD是一种基本的分子模拟方法,用于模拟原子或分子在一定时间范围内的运动轨迹。 在MD中,通过牛顿方程和势能函数来模拟系统中粒子的
第一个空间
2024-12-16 15:34:23
chenyuanjie
200ns-cMD练习记录(来源于第三期分享)
teakki技能分享教程: 第3期-分子动力学操作 分子动力学操作(GROMACS) 教程来源: GROMACS教程:漏斗网蜘蛛毒素肽的溶剂化研究:Amber99SB-ILDN力场|Jerkwin 原始文档来自 John E. Kerrigan(jkerriga@rutgers.edu, kerrigje@umdnj.edu) 一些关于分子动力学的知识 mkdir –p your_di
第一个空间
2024-10-25 16:36:06
chenyuanjie
9.21-10.4 cut-loop_vsREMD
确定需要的vsREMD副本数(25个) Temperature generator for T-REMD simulations (jerkwin.github.io) space-separated temperature list: 300.00 305.42 310.92 316.49 322.13 327.87 333.69 339.59 345.58 351.65 357.81 36
第一个空间
2024-04-30 11:06:48
chenyuanjie
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