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  • 一些中药(植物)有关的数据库
    化合物嵌入到学习的几种表示: 分子表示|如何将化学分子输入到深度学习模型中?(相关文献链接持续更新) - 知乎 2024.11.12 https://mp.weixin.qq.com/s/oyZIHU29xce4Ugd1IUmeJw 这里列了一些数据库 ETCM1.0/2.0 1.0里面有402中药,中药配方3959,成分7284,是Xu HY, Zhang YQ, Liu ZM, Ch
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  • 希腊字母表
    我们可以直接按照下表输入符号\后边的字母,然后在输入法中就会显示出两个大小写的希腊字母,从中选出我们想要的那一个即可。不过下表中的有些字母是打不出来的,但是如果使用word编辑的话,可以直接插入找到自己想要的字母即可。
  • 一些教程或工具的链接
    对接: smina对接 (见对接教程) glide-sp/xp等 (见对接教程) 共价对接: Glide共价虚拟筛选 RDKIT (还没试) RDKit|一站式搞定分子读取、输出、可视化 - 简书 (jianshu.com) 利用RDKit实现有机分子SDF文件与SMILES的相互转换 - 知乎 (zhihu.com)利用RDKit实现有机分子SDF文件与SMILES的相互转换
  • 转excel为csv
    本地xlsx上传到服务器显示: " zip.vim version v27 " Browsing zipfile /home/databank_70t/chenyuanjie/similarity-learn/TCM/20250227_test_scaf_h_r/test_h_r.xlsx " Select a file with cursor and press ENTER [Con
  • The integration of machine learning into traditional Chinese medicine(医研三人行) 杭州师范大学团队发表在journal of pharmaceutical analysis 杂志,影响因子6.1 A KG-Enhanced Multi-Graph Neural Network for Attentive Herb Rec
  • 化合物分类添加权重的尝试
    20241216组会: 化合物类型: 糖类、醌类、苯丙素类、黄酮类、萜类和挥发油、三萜类、甾体类、生物碱、其他(脂肪酸、有机含硫化合物、氨基酸换台蛋白质和酶、矿物质) 糖类: 多羟基糖或者多羟基酮及其衍生物聚合物的总称 单糖、二塘、多糖…… 醌类 分子内具有不饱和环二酮结构的有机化合物,有苯醌、萘醌、菲醌、蒽醌 苯醌: 萘醌: 菲醌: 蒽醌: 苯丙素类 以C6