zhangjianfang @zhangjianfang

批量突变蛋白： #从知乎上搜到了杨师兄的方法，原文链接：注意链的变化 Pymol|Pymol构建蛋白质点突变并优化 (qq.com) 批量预处理突变后的蛋白质分子：使用for循环 conda activate pdb2pqr for a in `cat index.log`;do pdb2pqr_cli --ff=amber --ffout=amber --chain --with-ph=

声明：笔记不是我写的 ，是摘抄的Hope的笔记，因为网络问题，浏览器无法打开该博主的教程网页，只有同学的手机可以，为了实时学习，所以将笔记摘抄下来，放在这里学习。 原文链接：https://blog.chembiosim.com/amber-cpptraj-tutorial-1/ 前言： #分析 mdout 文件中的能量信息 process_mdout.perl md.mdout mdo