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  • 二面角分布
    使用乐云师姐的脚本 752 cp /home/databank/lywu/kl-analysis/sys11/ py ./ 分析8个redock 成功的体系 脚本输入文件准备 batch4 complex 处理 752 /home/databank/MD_traj_dataset/D3PM/analysis/batch4/pbc 脚本做了修改 脚本添加apo轨迹处理参数 nohup
    MD 2025-11-17 21:28:26    zhouzhaoyin
  • amber24
    CPU 75.2 export PATH=/home/databank/zyzhou/software/amber24/amber_bin/bin:$PATH source /home/databank/zyzhou/software/amber24/amber_bin/amber.sh 75.2 /home/databank/zyzhou/software/amber24 sc
    MD 2025-11-14 09:57:03    zhouzhaoyin
  • MD Operation
    Written in front Please remember that this is a very rough tutorial (honestly, I’m somewhat ashamed to call it a tutorial because it’s too rough). The only purpose of this "tutorial" is to help you na
    share 2025-11-12 09:13:11    zhouzhaoyin
  • share 2025-11-10 19:14:04    zhouzhaoyin
  • install
    gmx-install 172.21.75.1 GPU4090 /home/dddc/zzy/software 安装openmpi conda create -n openmpi python=3.8 openmpi conda activate openmpi 安装cmake linux下cmake安装配置_linux cmake配置全局-CSDN博客 cd /home/
    MD 2025-11-07 19:23:31    zhouzhaoyin
  • 投稿
    11-7 ChemMedChem 2025年以来google scholar 查询到杂志发文 369篇，文中未出现“Synthesis"的仅64篇，占比17%。进一步，检查该杂志对中医药，网药的接受程度： 中医药 有部分文章研究对象与中医药相关，大多为从一个中药成分出发开始进行结构优化（如ChemMedChem 20.8 (2025): e202400907 introduction部分：Du
    HSBD 2025-11-07 10:13:30    zhouzhaoyin
  • 8sys cluster
    使用每个体系的关键氨基酸二面角作为feather来聚类 10us 轨迹合并 为方便聚类，将8个体系优先合并为10us 75.2 /home/databank/MD_traj_dataset/D3PM/analysis/cluster_com_top1_redock_suceess/10us_pbc_trjcat 聚类 计划是使用每个体系的关键氨基酸二面角作为feather 要先去看每个体系
    MD 2025-11-06 15:37:49    zhouzhaoyin
  • DeepPurpose
    二分类模型 案例 85.3 /home/yqyang/zzy/project/tcm-ai/binary-4qi/0427 输入数据准备 85.3 /home/yqyang/zzy/project/tcm-ai/binary-4qi/0427/data/train_input.txt 85.3 /home/yqyang/zzy/project/tcm-ai/binary-4qi/0427/
    share 2025-11-06 10:36:34    zhouzhaoyin