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conda conda命令直接安装是付费版的。 conda install -c conda-forge -c schrodinger pymol-bundle mac还需要： pip install PyQt5 以前的版本的话： conda install -c schrodinger pymol 付费版运行会直接报错，但是组里有Pymol_liscense，将该文件放入报错提示的文件夹

操作符大全 通用 已命名选择 逻辑 标识符 hetatm 非蛋白质本体 标识符匹配 实体扩展 注意：所有“ by-”运算符的优先级均较低，因此 (byres S1 or S2) 实际上相当于 (byres (S1 or S2))，而非 ((byres S1) or S2) 键扩展 距离 属性 标识 化学分类 样式 非分子

更新与下载 单线程 将下面的内容粘贴到sh文件中 rsync -rlpt -v -z --delete --port=33444 \ rsync.rcsb.org::ftp_data/structures/divided/mmCIF/ ./ rsync更新或下载数据库，下面是详细的解释。 `-r`: 递归地复制目录及其内容。 `-l`: 保留符号链接。 `-p`: 保留文件权限。 `-t`:

1.确定条件 反应路线是根据经验和实验已知现象（如监测到哪些产物生成，投料比等）进行推测的，量化计算的目的主要是通过计算这条路线上的所有体系的吉布斯自由能，说明反应能垒是合理的，可以跨越的。中间体是势能面的极小值点，过渡态是鞍点。然而，实际反应可能有很多条通路通向反应终点，量化计算并不能揭示出这些路线，因此只要计算合理即可，不必纠结。 1.1优化方法 最低级别：MM2(Chem3D自带的)，后面