PDB数据库本地

更新与下载

单线程
将下面的内容粘贴到sh文件中
  • rsync -rlpt -v -z --delete --port=33444 \
  • rsync.rcsb.org::ftp_data/structures/divided/mmCIF/ ./
rsync更新或下载数据库,下面是详细的解释。
`-r`: 递归地复制目录及其内容。
`-l`: 保留符号链接。
`-p`: 保留文件权限。
`-t`: 保留文件时间戳。
`-v`: 启用详细输出模式,显示正在同步的文件列表。
`-z`: 启用压缩传输,以减少数据传输时的带宽占用。
`--delete`: 删除本地目录中不存在于远程服务器上的文件和目录。这将确保本地目录与远程目录保持同步。
`--port=33444`: 指定使用的端口号为33444。
`rsync.rcsb.org::ftp_data/structures/divided/mmCIF/`: 这是源目录,它指定了要同步的远程目录。
- `./`: 目标目录,同步的文件将被保存在这个本地目录中。
rsync具有增量复制特性,仅传输发生更改的部分,而不是整个文件,这样可以大大减少传输所需的时间和带宽。因此可以用来更新,语句中却不需要出现更新字样
命令行运行:
  • nohuop sh download.sh &

更新情况

2023年9月18日:cpu256: databank/www_PDB_20230918