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@analoguecomputation 模拟计算 @wlzhu_team 课题组公共空间 @trip13 trip13 @srse 科研小技能交流
  • 4.11 pl monomer
    75.3 /home/data/zyzhou/project/hsbd/2025-4bioactive cp -r sys-pre/ 2sys-pl-monomer 蛋白准备 本次重新准备，全部选用 D3Docking 库中的 受体结构文件（pdb) - pdb2pqr 75.3 /home/data/zyzhou/project/hsbd/2025-4bioactive/2sys-pl-m
    HSBD 2025-04-14 18:31:44    zhouzhaoyin
  • 2025-4-2 SMD
    输入文件 85.9 /home/databank/zzy/people/zyzhu cp ~/zhuziyu/trip13/MDtest/md-operation/pre-equilibration/0168/npt/npt.gro ./ cp ~/zhuziyu/trip13/MDtest/md-operation/sys-pre/tleap/0168-tleap/gmx/topol.to
    people 2025-04-02 12:15:30    zhouzhaoyin
  • 10.18 gmx_2022.5_vs install
    配置GROMACS-2022.5 服务器：22223 172.21.85.23 /home/databank/zzy/software/vsremd-2022.5 下载安装包以及vsREMD的参数文件replicaexchange.cpp（这里是从22224上cp过来的） tar -zxvf gromacs-2022.5.tar.gz 需要指定高版本gcc和g++的路径，写进环境变量也不太行
    usp18 2024-03-07 18:42:03    lywu