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  • gromacs 2022 安装
    注：文中路径需替换为自己的路径 安装gcc,openmpi conda create -n gcc_8_5 -c conda-forge gxx_linux-64=8.5.0 gcc_linux-64=8.5.0 sysroot_linux-64=2.17 python=3.8 openmpi conda activate gcc_8_5 which gcc # 会发现gcc版本没变
    share 2024-03-12 09:04:16    zhouzhaoyin
  • Supporting software (package) installation
    cmake conda install anaconda::cmake gcc 1. install gcc 1.1 下载压缩包 wget http://ftp.tsukuba.wide.ad.jp/software/gcc/releases/gcc-12.2.0/gcc-12.2.0.tar.gz tar -zxvf gcc-12.2.0.tar.gz 1.2 下载安装依赖项
    share 2024-03-09 22:51:33    zhouzhaoyin
  • 配置GROMACS-2022.5
    2024.3.7 - 3.8 1. install gcc 1.1 下载压缩包 wget http://ftp.tsukuba.wide.ad.jp/software/gcc/releases/gcc-12.2.0/gcc-12.2.0.tar.gz tar -zxvf gcc-12.2.0.tar.gz 1.2 下载安装依赖项 cd gcc-12.2.0 ./contrib/d
    share 2024-03-08 11:57:08    zhouzhaoyin
  • 10.18 gmx_2022.5_vs install
    配置GROMACS-2022.5 服务器：22223 172.21.85.23 /home/databank/zzy/software/vsremd-2022.5 下载安装包以及vsREMD的参数文件replicaexchange.cpp（这里是从22224上cp过来的） tar -zxvf gromacs-2022.5.tar.gz 需要指定高版本gcc和g++的路径，写进环境变量也不太行
    usp18 2024-03-07 18:42:03    lywu
  • scripts
    share 2024-02-27 22:34:46    zhouzhaoyin
  • 0226
    0226 两千多种天然产物与40+种新冠相关靶标蛋白作用的预测研究： The target prediction of more than 2000 natural products from HSBD. get compound from 14 tcm which make up HSBD. “黄芪”在数据库中无
    HSBD 2024-02-27 09:38:18    zhouzhaoyin
  • writing
    英文论文写作： 小四，双倍行距，Times New Roman
    share 2024-02-26 08:54:14    zhouzhaoyin
  • 任务书
    考核指标： 在抗新冠肺炎的D3Docking模块中，增补与新冠肺炎相关的靶标； 在D3Similarity中增补文献中新发现的抗冠状病毒化合物； 完成化湿败毒方所含两千多种天然产物与至少40种新冠相关靶标蛋白作用的预测研究； 完成不少于10个化湿败毒方-潜在靶标对接复合物的分子动力学模拟； 开展不少于5个单体成分的靶标结合活性测试； 初步阐明抗病毒活性机制；
    HSBD 2024-02-20 10:41:55    zhouzhaoyin