D3pocket架构

已有架构:85.23/software/D3Pockets_WEB_UCB
环境依赖:D3Pockets(conda),具体参见周丽萍师姐:D3pockets移植及测试
requirement:
75.4:D3pockets(
工作管线:
1.预处理
路径:/home/databank/gxxu/Backup/Moleculardynamics/4D3pocket_input/shs
脚本:2xtc.py:产生轨迹文件
importmysql.py:信息录入数据库
2.跨服务器的数据库流
get_files():遍历所有数据库中所有pdbid的,传过来。
send_files():传过来的文件分析完,然后传回去。
D3Pocket_MD_Batch.sh是批量实现D3Pocket_MD_Script.sh的版本。
3.D3pocket
以上旧版,未重构
重构版本:test_re_1:继承自python3版本的d3pocket,统一了matrix2heatmap过程。