D3pockets.2.0 log
主扇区：
参数：
{
- topfile:拓扑文件，.pdb文件
- trajfile:轨迹文件，增加支持轨迹类型：.xtc,.dcd
- outputdir:输出目录
- logdir:日志目录
- gpus:指定GPU
- framesdir:帧文件路径
- pocket_detect params{
- bradius;
- sradius;
- stepsize;
- }
- ligand:配体文件
}
绘图模块：
对外接口模块：
文件操作模块：
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2025-11-17:正式写了，还是原来的原则，自顶向下；
绘图用draw还是plot呢？plot，
先就是稳定口袋的分析，检测口袋出来这一步骤很关键，先是选出代表帧。
哥们真的忍不了，直接写个detectpocket的核函数不好吗，还真不行，因为cluster过程是用的第三方的库。这样先过渡，用1：1：1的方式，聚类前面的可以用作为一个核函数，聚类用一个，聚类后面的用一个核函数。
2025-11-6:重新看一下代码，找一下思路。印象中，好像架构已经完成了，开始向外的构建了。要不再画一个架构图吧。
2025-11-13：开始编写D3pockets2.02版本，重新找回思路