周丽萍 @957zlp

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考虑卤键的设置 脚本筛选打分高于或者低于某个cutoff的 SP对不进去，XP可以的情况下，处理办法 这种情况比较少见，一般是SP可以XP不行。可能是结构采样的问题。 可以进Advanced settings，点Use enhanced Sampling, 然后下面选4。 或者先用Macromodel Conformational Search采样，Maximum number

Tutorial https://torchprotein.ai/ Github https://github.com/DeepGraphLearning/torchdrug/ Installation 服务器上的gcc版本太老了，会报如下错误，所以更新了gcc gcc: 错误：unrecognized command line option ‘-std=c++14’ conda cr

非root安装ninja https://blog.csdn.net/xiaoyaolangwj/article/details/119382717 下载依赖包re2c https://github.com/skvadrik/re2c/releases ; 按照以上教程安装好re2c 2.2之后 (base) [chpeng@localhost re2c-2.2]$ ../ninjatest

配置vscode 远程开发+ 免密登录 - 知乎 (zhihu.com)

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pymol 平移动画 set movie_auto_store, 0 mset 1x20 #配体向上平移20，向右平移80,存储为第1帧 translate [0, 20, 0], object=ligand translate [-80, 0, 0], object=ligand #rotate x, 20, object=ligand mview store, 1, object

用薛定谔目录下的run执行 run jupyter notebook 即可import薛定谔的包 配合“本地vscode 打开服务器上的jupyter notebook”教程食用更佳