hanzijian @hanzijian

We usually use the Amber ff14 and Gaff force fields for the protein and the ligand, respectively, but any other force field can be in principle be used. In the RAMD procedure, RAMD simulations must

课题组账号 647205 安装手册 https://jianguoyun.simm.ac.cn/p/DRvhnZMQKhi3Dw

conda conda命令直接安装是付费版的。 conda install -c conda-forge -c schrodinger pymol-bundle mac还需要： pip install PyQt5 以前的版本的话： conda install -c schrodinger pymol 付费版运行会直接报错，但是组里有Pymol_liscense，将该文件放入报错提示的文件夹

操作符大全 通用 已命名选择 逻辑 标识符 hetatm 非蛋白质本体 标识符匹配 实体扩展 注意：所有“ by-”运算符的优先级均较低，因此 (byres S1 or S2) 实际上相当于 (byres (S1 or S2))，而非 ((byres S1) or S2) 键扩展 距离 属性 标识 化学分类 样式 非分子

更新与下载 单线程 将下面的内容粘贴到sh文件中 rsync -rlpt -v -z --delete --port=33444 \ rsync.rcsb.org::ftp_data/structures/divided/mmCIF/ ./ rsync更新或下载数据库，下面是详细的解释。 `-r`: 递归地复制目录及其内容。 `-l`: 保留符号链接。 `-p`: 保留文件权限。 `-t`: