Amber20配置安装方法
下载Amber20和AmberTools20
解压压缩包
- tar -xf Amber20.tar.bz2
- tar -xf AmberTools20.tar.bz2
安装串行版
- cd amber18
- ./configure_cmake.py --prefix /home/xbzhang/Amber20/amber20(安装目录) --no-miniconda(20版自带miniconda带的python版本有问题) --with-python /usr/local/bin/python3(指定系统自带的python)
- make j8 install
注意gcc版本不能是5以上版本
安装并行版
- cd amber18
- ./configure_cmake.py --prefix /home/xbzhang/Amber20/amber20(安装目录) --no-miniconda(20版自带miniconda带的python版本有问题) --with-python /usr/local/bin/python3(指定系统自带的python) --mpi --openmp
- make j8 install
安装gpu版
- cd amber18
- ./configure_cmake.py --prefix /home/xbzhang/Amber20/amber20(安装目录) --no-miniconda(20版自带miniconda带的python版本有问题) --with-python /usr/local/bin/python3(指定系统自带的python) --mpi --cuda --openmp
- make j8 install