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  • 0626 记录
    化湿败毒方潜在靶标预测 两千多种天然产物与40+种新冠相关靶标蛋白作用的预测研究： 14味中药：生麻黄、杏仁、生石膏、甘草、藿香、厚朴、苍术、草果、法半夏、茯苓、生大黄、生黄芪、葶苈子、赤芍 搜索结果：生石膏库里没有，共有13个中药，其中：生黄芪为黄芪；法半夏为半夏，藿香为广藿香，杏仁为苦杏仁 for i in `cat hsbd-herb_index`;do grep -w "$i" ../
    HSBD 2024-06-29 14:53:30    zhouzhaoyin
  • 0626 results
    化湿败毒方潜在靶标预测 1. 收集化湿败毒方中的成分 两千多种天然产物与40+种新冠相关靶标蛋白作用的预测研究： 14味中药：生麻黄、杏仁、生石膏、甘草、藿香、厚朴、苍术、草果、法半夏、茯苓、生大黄、生黄芪、葶苈子、赤芍 搜索结果：生石膏库里没有，共有13个中药，其中：生黄芪为黄芪；法半夏为半夏，藿香为广藿香，杏仁为苦杏仁 去重后共得到2049个成分 2. 靶标预测（VS) 2.1 D3A
    HSBD 2024-06-28 18:03:26    zhouzhaoyin
  • plan
    目标 (任务书 考核指标）： 写文章 药学学报 完成化湿败毒方所含两千多种天然产物与至少40种新冠相关靶标蛋白作用的预测研究； 完成不少于10个化湿败毒方-潜在靶标对接复合物的分子动力学模拟； 两千多种天然产物与40+种新冠相关靶标蛋白作用的预测研究： Overall, a total of 343 chemical compounds were initially characteri
    HSBD 2024-06-28 08:29:01    zhouzhaoyin
  • 服务器软件目录
    更新日期：2021.12.29 -lywu
    share 2024-06-27 12:00:51    zhouzhaoyin
  • 6.22 vsREMD
    vsREMD的编译完全独立，要重新解压从gmx上下载的安装包，替换replicaexchange.cpp文件，在一个新的文件夹下从头安装，所有的路径都要和原来的cmd版本区分开 85.24 /home/lywu/software/gmx/vsremd-2022.5/replicaexchange.cpp # cmake 在编译普通版的时候装过了 # 指定路径即可使用 export PATH
    MD 2024-06-22 15:06:00    zhouzhaoyin
  • 现象
    xcy: ligand-docking core constraint 后打分显著提高（2-3分）！
    share 2024-06-18 19:33:36    zhouzhaoyin
  • EquiScore
    85.3 (jawang 123456) /home/jawang/zzy/ai-vs/EquiScore 1.复制脚本到你的路径 cp -r /home/jawang/zzy/ai-vs/EquiScore/test ./ # test 文件夹下有file,output,EquiScore-run.sh三个东西 # file 用于存放输入文件 # output 是输出的原始文件
    share 2024-06-12 13:37:47    zhouzhaoyin
  • study material
    What are the main differences between HTVS, SP, and XP docking? (schrodinger.com) Docking and scoring - Schrödinger (schrodinger.com)
    share 2024-06-06 18:50:01    zhouzhaoyin