gaoxiangxu @gaoxiangxu

主扇区： 参数： { topfile:拓扑文件，.pdb文件 trajfile:轨迹文件，增加支持轨迹类型：.xtc,.dcd outputdir:输出目录 logdir:日志目录 gpus:指定GPU framesdir:帧文件路径 pocket_detect params{ bradius; sradius; stepsize; } ligand:配体文件 } 绘

数据库进度： D3pockets：{ protein_info导入了， ligand导入了， dynamics_simulaiton:暂时不考虑； pockets表，用后面PDBbind中的数据 } Drugbank: { structures数据导入了， drug_interaction数据不用导入，后面完成一个药物相互作用查询逻辑， drugs中的name和cas_number导

已有架构：85.23/software/D3Pockets_WEB_UCB 新架构： 目标继续：将Pypocketsdescriptor纳入到D3pockets架构中 环境依赖：D3Pockets（conda），具体参见周丽萍师姐：D3pockets移植及测试 requirement: D3pockets.2.0 (忽略版本号）参考75.4环境D3pockets 75.4：D3pockets(

#define Research Scales: #Cell/Organism只是标识，代表尺度范围，不代表任何实体 { Atom|unconcerned temperory； (subMolecule,Molecule,MacroMolecule); (subCell, Cell, macroCell); (sub ) (subOrganism, Organism, mac

服务器：75.5 路径：/home/dddc/software/ 版本：2022a 安装步骤： 1.修改安装配置文件：只修改带一个#的条目 input_bygxxu.txt{ destinationFolder=/home/dddc/software/matlab/R2022/ fileInstallationKey=50874-33247-14209-37962-45495-25133-28