mgltools安装

（207服务器）
下载对应版本的安装包
Downloads – mgltools (scripps.edu)
  • conda create -n mgltools-zlp python=2.7
    • 

  • conda activate mgltools-zlp
    • 

  • tar xvf mgltools_x86_64Linux2_1.5.7.tar_.gz
    • 

  • cd mgltools_x86_64Linux2_1.5.7/
运行脚本显示缺少MolKit模块
  • python /home/g16/prog/mgltools_x86_64Linux2_1.5.7/MGLToolsPckgs/AutoDockTools/Utilities24/prepare_dpf4.py
    • 


    • 


    • 

  • Traceback (most recent call last):
    • 

  •   File "/home/g16/prog/mgltools_x86_64Linux2_1.5.7/MGLToolsPckgs/AutoDockTools/Utilities24/prepare_dpf4.py", line 10, in <module>
    • 

  •     from MolKit import Read
    • 

  • ImportError: No module named MolKit
修改环境变量
source ~/.bashrc即可正常运行
  • pythonsh $MGL_ROOT/MGLToolsPckgs/AutoDockTools/Utilities24/prepare_gpf4.py
    • 

  • pythonsh $MGL_ROOT/MGLToolsPckgs/AutoDockTools/Utilities24/prepare_dpf4.py
    • 

  • pythonsh $MGL_ROOT/MGLToolsPckgs/AutoDockTools/Utilities24/prepare_ligand4.py
    • 

  • pythonsh $MGL_ROOT/MGLToolsPckgs/AutoDockTools/Utilities24/prepare_receptor4.py