匹配查找HIT.py

input_file = "/home/databank/pengziyu/PAK4/0523-library3/HIT/HIT.txt"
Library = "/home/databank/pengziyu/PAK4/CompoundLibrary4.txt"


# 读取Library文件内容并存储在一个集合中
with open(library_file, 'r') as libfile:
集合： mol_smiles = {line.split('\t')[0] for line in libfile if line.strip()}
    strip() 方法用来移除字符串头尾的空白符，包括空格、换行、制表符等
    split() 用于按照指定的分隔符将字符串分割成多个部分，结果是一个列表。


列表：library_content = [line.split()[1] for line in libfile if len(line.split()) > 1]   

# 打开library_file文件用于逐行查找:这种方法在每次检查时都需要遍历 library_lines，因此时间复杂度较高。如果 Library 文件很大，这种方法可能会非常慢。
with open(library_file, 'r') as libfile:
    library_lines = libfile.readlines()


#使用集合的方法：内存占用相对较大，但查找速度快，适合文件较大、查找次数较多的情况。
#逐行查找的方法：内存占用小，但查找速度慢，适合文件较小、查找次数较少的情况。


with open(input_file, 'r') as infile:
    for line in infile:
        line = line.strip()  # 去除行末的换行符和空格
        if line in Library:
          print(f'Matched: {line}')