一、OmniPathR 是“联网访问 + 可离线缓存”机制,不是完全离线工具 官方设计理念(OmniPathR 文档) “OmniPathR retrieves all data from the central OmniPath web service (https://omnipathdb.org). However, all downloaded data are cached local
COSMOS(Causal Oriented Search of Multi-Omics Space)也是omnipath团队成员参加开发的,是一种整合多组学数据与先验知识(也使用了omnipath数据库建立知识网络)、通过因果推理生成机制假设的分析方法,目标是从转录组学、磷酸化蛋白质组学、代谢组学等多组学数据中,系统提取分子机制假设。其文章“Causal integration of multi