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Oleoyl-CoA.sdf -O Oleoyl-CoA.mol2 --gen3d --ff gaff
gjf
antechamber -i Oleoyl-CoA.mol2 -fi mol2 \
-o lig.gjf -fo gcrt \
-at gaff2 \
-gn "%nproc=4" \
-gm "%mem=4GB" \
-gk "#B3LYP/6-31G* em=gd3bj pop=MK iop(6/33=2,6/42=6) opt" \
-nc -3
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