根据Uniprot号批量下载PDB
GetPDB
配置教程见
(julia最好安装高版本的,不然后续安装其他包的时候会出现问题)
另外需要安装dos2unix
- tar xvf hd2u-1.0.0.tgz
- cd hd2u-1.0.0/
- ./configure --prefix="/home/chpeng/software/hd2u-1.0.0/hd2u/"
- make
- make install
julia安装General 和BioStructures
由于服务器不能连接github,所以安装包的时候只能下载到本地进行安装
先安装General
1 用一台能够连接github并且安装了git的电脑将安装包git clone下来
2 将包放到~/.julia/registries下面 (没有这个文件夹可创建一个)
3 运行以下代码
- cd ~/.julia/registries/
- julia
- ] #切换成Pkg模式
- add Genaral
实际上这一步我并没有正常运行,但是后续按照同样的方式安装BioStructures就成功了!!!