12.18 discuss with prof
- HSBD 2049个成分与3CL/PLpro对接(D3Targets-D3Docking 多构象);
- 挑选打分rank1,且可药性好(excellent)的化合物(200个)聚类,得到48类,取每一类中打分最高的化合物出来;
- 考虑到可购买性,选择了13个化合物,均已购买,3CL计划送至上中医,PLpro送至藏奕老师组;
- 两个体系的MD已跑完;
- 还剩11个化合物,12.18与徐老师讨论后,计划先将11个化合物对接至目前晶体结构分辨率最好的3CL,PL单体构象上,跑MD