cpptraj Install&Usage

wget https://github.com/Amber-MD/cpptraj/archive/refs/heads/master.zip
./configure -openmp gnu -nomathlib
make install


vi ~/.cpptraj-20240813.OMP.sh
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## cpptraj 20240813 installed
## Usage: cpptraj.OMP
export PATH=/home/dddc/zzy/software/cpptraj_20240813/cpptraj-master/bin:${PATH}
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source ~/.cpptraj-20240813.OMP.sh
cpptraj.OMP

1. 某一个功能缺失的时候，考虑是否受到了版本 限制（本文即为为解决该问题，而安装新版本）
2. ./configure 的时候，可以考虑 -j XX 加快速度，但是有时候多核会报错
3. 缺库很麻烦，本文是最幸运的情况，所有库都齐全
4. 装完了软件，通常去bin里找可执行文件，写对应的环境变量

1. Releases · Amber-MD/cpptraj (github.com)
2. Start here – AMBER-hub (utah.edu)

20241024 更新：

/usr/bin/ld: cannot find -lgfortran: No such file or directory

sudo ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgfortran.so.5.0.0 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgfortran.so