思路

  1. 交换率不能高于0.4
  2. vsREMD 得到的pathway, 对应新方法的 区间的采样点，聚类，最大簇的结构作为初始构象,  去跑CMD
实际需求
  1. 给定一个 temp, top ， example.mdp 自动流程化调参
  2. 可以 用户自定义 副本数 理想交换率 
  3. 调试阶段可以0.1ns（-replex 100) 就够了，最后需要跑一个1ns的确认交换率